多数患者都能够耐受普通的肠镜检查。普通肠镜在检查过程中会应用局部的润滑剂减轻患者的不适感。检查过程中肠镜要经过肠管的多个弯曲，操作熟练的医生可以在操作过程中让肠镜尽量取直，增加患者的舒适度。此外减少充气也能增加患者的舒适度。如果术前做了充分的肠道准备工作，肠道清洁度好，操作的时间缩短，患者的舒适度就会提高，并且更不容易漏诊。