急性胃肠炎的患者需入院检查有无幽门螺杆菌的感染。若其感染指标较高，可使用两种抗生素，配合奥美拉唑或奥硝唑进行治疗。其中，抗生素的选择可为克拉霉素或阿莫西林。患者还可采取两联抗生素进行治疗，如克拉霉素配合左氧氟沙星。而急性肠炎的患者，需培养大便，若存在大肠杆菌感染，可使用相应的广谱抗生素；若为痢疾杆菌感染，则需使用左氧氟沙星、头孢类药物。