肠系膜上静脉血栓形成的死亡率，目前尚缺乏确切的统计数据。病情较轻者，多无明显临床症状，部分患者可能有腹部隐痛不适，逐渐发展为慢性过程；病情较重者如不及时治疗，可能引起易栓症，导致肠系膜静脉血栓反复发作，不能治愈，严重者可导致大范围的肠坏死，以至于不得不切除肠段，甚至危及生命。因此，严重的肠系膜上静脉血栓形成，其死亡率相对较高。