手术是肾盂癌的首要治疗方法，术后大多需化疗。肾盂肿瘤的同时易并发膀胱肿瘤，肾盂癌是多灶性移行上皮细胞癌，其手术范围广泛，需切除来源于同个移行上皮的肾脏、输尿管及部分膀胱。早期肾盂癌术后仅行局部膀胱化疗药灌注治疗，每周一次，共灌注6-8次，恶性程度和浸润级别均较高的晚期肾盂肿瘤，术后1-2个月内进行1次全身化疗，可减少局部淋巴转移和潜在全身肿瘤转移的可能性。