急性肾盂肾炎患者可主要服用针对革兰氏阴性杆菌的药物，如头孢、青霉素或喹诺酮类药物。尿路感染分为上尿路感染与下尿路感染，肾盂肾炎是上尿路感染的类型之一。肾盂肾炎的感染途径包括上行感染、血行感染及淋巴感染，约80%肾盂肾炎由上行性感染所致，上行性感染的细菌多数为革兰氏阴性杆菌，其中，大肠杆菌最为多见，患者可主要针对革兰氏阴性杆菌进行治疗。对肾盂肾炎患者进行治疗前，一般应首先进行尿液培养，以筛选敏感药物。