临床认为新生儿肺炎并无后遗症之说，因多数患者经及时治疗均可治愈。但若为重度肺炎，较易合并呼吸衰竭、循环衰竭、败血症、休克、DIC以及脑膜炎等并发症。其中，呼吸衰竭患儿表现为呼吸急促、呼吸困难、口吐泡沫等，呼吸频率增快至60次/分以上；循环衰竭则表现为心衰，通常会造成患儿呼吸急促、面色发灰、心率增快至60-180次/分以上；败血症的表现为发热、黄疸加重或退而复始，肝脾肿大、皮肤花纹等症状；脑膜炎的症状，表现为昏迷、呕吐、频繁抽搐等。