巨脑回畸形的严重程度，与畸形部位、畸形范围等相关。脑回的多少、脑回和脑沟的深度，可能与智力成正比关系。严重时，可导致双侧巨脑回畸形，甚至无脑回畸形，而导致较严重后果，可能发生各种功能障碍，产生痴呆、癫痫发作等表现，成为残疾儿。但如果仅局限于一个脑沟或脑回，可能仅表现为癫痫发作，平常均属正常表现。故若影响范围较小，危害相对较轻。