肛门疼痛的原因主要因肛门的神经非常丰富，感觉敏锐，当受到刺激的时候容易造成疼痛，表现为坠痛、胀痛、烧灼样痛等。肛门疼痛主要是肛门内及肛门直肠周围的一种疼痛症状，为多种肛门直肠疾病所共有。常见的原因有痔、瘘、裂、血栓性外痔、内痔嵌顿、肛门直肠异物、肛门直肠癌、肛门直肠手术后刺激等这些情况。其疼痛性质和程度，根据各种原因各不相同。