玻璃体切除手术是眼科较难的手术之一，其他手术可能的并发症，在玻璃体切除手术上都可能出现。临床上最常见的并发症如继发性青光眼、并发性白内障、视网膜脱离，进行玻璃体切除手术时若眼内出血，做手术过程当中无法止血，或出现脉络膜上腔驱逐性出血，即脉络膜上腔大出血，都是很危险的因素。还有眼内炎、眼内细菌感染等等。有时术前视力还可以，做完手术视力可能并不是很好。但是并不是可能出现并发症就不能做手术，随着现在微创技术发展，剥切手术并发症越来越少，甚至不用缝线，术后的恢复很快。