双胎妊娠出现胎儿结构异常的概率较单胎妊娠高1-2倍，在双卵双胎妊娠中，胎儿畸形的发生概率与单胎妊娠相似，而在单卵双胎中胎儿畸形的发生率增加2-3倍。最常见的畸形为心脏异常、神经管缺陷、面部发育异常、胃肠道发育异常和腹壁裂等。建议在妊娠18-24周最晚不要超过26周，对双胎妊娠进行超声结构筛查，双胎妊娠容易因胎儿体位的关系影响结构筛查的质量，导致筛查较为困难。有条件的医疗机构可以根据孕周分次进行，包括胎儿心脏在内的结构筛查，如发现可疑异常，应及时转诊至区域性的产前诊断中心。双胎妊娠通过三维超声进行胎儿畸形的排查最佳时间段为孕22-26周。