肠镜的检查费用在不同的医院可能收费标准不太一样，比如在一级医院、二级医院、三级医院费用不一样。在三级医院做肠镜，费用大概是200-300元之间。当然肠镜还分普通肠镜和无痛肠镜，因为中国现在检查提倡舒适性医疗，所以肠镜有时候感觉有点不舒服，所以建议患者做无痛肠镜。无痛肠镜一般打麻醉药以后，让患者在睡梦中完成检查，费用可能比较高，大概费用要1000元左右。当然结肠镜检查费用还不包括清洁肠道的药物，因为要把肠道清洁干净以后才能完成结肠镜检查，清洁肠道的药物费用大概要30-50元之间不等，因人而异，因为要根据平时便秘的情况，所以选择的清肠药物不一样。