脑干出血术后呼吸不平稳首先要排除气道因素，检查有无气道梗阻表现，可对症使用呼吸机辅助呼吸。如果发生脑干出血，且这些因素都已排查，还未好转，可用些激素，针对脑干出血呼吸不平稳的原因，做些处理措施。脑干出血呼吸不平稳还来源于脑干部位的血肿造成的对周围组织、对呼吸中枢的压迫。可以用些激素类的药物进行处理。还有部分患者呼吸没回来，疗效也不会太好，很可能会死亡。