配子输卵管内移植术成功率相对于试管婴儿要低一些。因为试管婴儿目前临床上应用比较多，也是相对比较成熟的技术，其成功率能够达到50%-60%。而配子输卵管内移植成功率，据不完全统计目前只有20%-30%，所以目前临床上很少应用这种技术。一般情况下，如果能够做试管婴儿，建议尽量做试管婴儿。虽然如此，但是配子移植也可能有其好处，好处就是更能模拟人类本身的生理过程。因为人类本身的生理过程，正常的情况下就是在输卵管内受精。而配子移植就是把体外取出的卵子和精子，在腹腔镜的操作下，将精子和卵子放到输卵管的壶腹部，这样更适合人的生理结构。但是该技术也有缺点，缺点就是可能有创伤，需要借助于腹腔镜，不像试管婴儿的操作直接移植到宫腔内即可。