激光治疗近视眼会造成一定的后遗症，后遗症的发生率很低，不会有后遗症出现，只有少部分的人会出现后遗症。后遗症主要是由于激光对角膜的削切作用，会引起角膜上皮的损伤，导致产生眼睛的干涩、不舒服的感觉，干眼症不舒服的感觉，随着手术后的恢复，角膜上皮自然的生长、恢复以及神经的恢复，经过3-6个月时间可以康复，不会产生很大的干扰或不舒服的感觉，完全可以自己痊愈。另外的副作用主要是视觉方面的感受，由于视力看得很清楚，同时由于削切是一部分的削切，有时会出现视觉方面的眩光。随着时间的延长，逐渐对视觉适应，也逐渐减轻到最低，出现后遗症的几率比较低，与提高视力相比，作用显得微不足道。