患者睡着后咳嗽的原因有以下几种：1、理化因素：可能是在卧室有理化因素刺激，如被子、毯子；2、急慢性支气管炎：患者睡着时副交感神经、迷走神经兴奋，可能会出现咳嗽加重。如果患者患有急慢性支气管炎的过程中，睡着以后患者胃肠道反流，导致呼吸道在原有感染的基础上加重咳嗽；3、慢性心功能不全：患者平卧时回心血量增加，导致心功能不全、肺静脉压力增高，支气管黏膜受到刺激，加重夜间咳嗽。如果患者睡着后咳嗽，可以请专家和医生检查进一步排查原因，采取合适的治疗措施。