眼睛细菌感染可能会自愈。少量、轻微的细菌感染，可以自愈，但是大量的细菌、严重的感染，需要积极的治疗。结膜囊含有正常的菌群，这些菌群相互制约，与人体共存。在通常的情况下，正常的菌群不会损伤到机体。但是如果身体疲劳，身体的抵抗力下降，同时伴随着结膜、角膜的损伤，这个时候细菌可能趁虚而入，引起结膜炎、角膜炎。所以，在自然的情况下，机体含有一定的细菌菌群，轻微的损伤，通过自然休息，通过正常营养，可以排出细菌，达到自愈。严重的感染，需要通过医生的帮助和药物进行相应的治疗。因此，身体的抵抗力、正常的免疫力非常重要，很多轻微的感染，可以通过正常的免疫力、抵抗力自愈。