近亲结婚所生的孩子并不一定会有问题，而是患病的几率比较高，由于近亲结婚生下的孩子来自共同的祖先，携带有患病基因的可能性较大。每个人身上都具有患病基因，但人体是否患病，通常由两个基因位点决定，一个来自父源，另一个来自母源，如果两个当中有一个属于正常，另一个属于异常，这时孩子不会发病。只有两个同样的致病基因都遗传给孩子，这时才会发病。如果近亲结婚，孩子的父母携带有同样致病基因的可能性比较高。而非近亲结婚，虽然有致病基因，但属于不同种类的致病基因，所以孩子不会发病。