阴茎癌的切除一般在全麻或半身麻醉下进行，切除的时候不会感到疼痛，伤口长好后也不会疼痛。但少数患者由于阴茎切掉一部分，会有断肢痛，疼痛与感觉异常有关，与局部麻醉手术或手术创面的生长无关。阴茎癌的手术一般要进行腹股沟淋巴结的清扫，由于阴茎癌的大小不同，手术切除的范围也不一样。目前临床上手术会尽量保留患者站立排尿的能力，但如果肿瘤侵犯超过龟头，一般要做整个阴茎的切除，然后做尿道改道，一般患者就无法站立排尿。