确诊腹腔结核最直接的金标准是做腹腔组织活检。常规采取腹腔镜取相应的组织进行病理活检，如果病理组织中找到结核分枝杆菌或者有典型的干酪样肉芽肿，就可以确认其是腹腔结核。 临床上确诊腹腔结核相对较为困难，因为腹腔结核的患者主要是存在腹腔积液，积液中的结核杆菌较为少见，难以寻找，单纯腹腔结核病人接受腹腔镜治疗的比例液较低。所以腹腔结核的病人大部分都是临床诊断结合抽血检测、腹腔积液相关检测，综合分析进行诊断。