人乳头瘤病毒主要的传播途径是接触，尤其是性接触，所以女性的人乳头瘤病毒感染最常见的部位是在性器官，性器官有不同的部位，具体如下：1、阴道口：尤其是后联合部位，无论是低危型还是高危型的病毒均容易感染；2、宫颈口：也是容易感染的部位，如果男性尿道口有人乳头瘤病毒感染，女性的宫颈口也比较容易感染，这是女性宫颈通常会查出比较多的病毒，尤其是高危型病毒感染的重要原因；3、阴道壁：阴道口和宫颈口之间的部位属于阴道壁，也有可能发生人乳头瘤病毒感染；4、其它：比如女性的尿道口、小阴唇内侧或外侧等。