进行膀胱镜检查后小便特别痛，其主要是由于膀胱镜对尿道黏膜的直接刺激造成尿道黏膜充血、水肿、肿胀，尿道黏膜的感觉神经特别敏感，其疼痛的机制与常见的尿道炎相似，具体处理措施有以下几个方面：1、多饮水：鼓励患者尽量多饮水，冲刷尿道；2、应用消炎止痛药：可使用消炎止痛药，比如临时在肛门处塞入吲哚美辛栓，因为膀胱镜检查后的小便疼痛一般在术后6-8小时特别明显；3、应用抗生素：若怀疑患者之前就可能有泌尿系感染，此时最好先验尿常规，若尿常规中有大量白细胞，提示可能合并尿道炎。此时的治疗可采用抗生素治疗，代表性的药物有左氧氟沙星、头孢类抗生素等；4、中医治疗：还可以采用中医淋证的治疗方法，使用癃清片中成药来进行治疗，有助于控制排尿疼痛的症状。