埋线是传统针刺疗法和现代医学的有机结合，所以通常不存在副作用。埋线的作用机理，是将线埋入穴位后在局部组织产生理化反应。另外线体埋入穴位后，吸收需要一定时间，这样可以对穴位产生持久的刺激作用，从而激发人体精气，达到治愈疾病的目的。 如果按照操作规范进行埋线，通常不会存在副作用。另外随科技进步，胶原蛋白线已经取代传统的羊肠线，其吸收较好，且安全不过敏。