超声内镜检查通常在消化科进行，通常镜子安装在胃镜系统上，所以这项检查通常不是由超声医生来做。但是此项检查与胃镜类似，有些人会觉得并没有痛苦，但有些人可能会比较担心。如果担心会比较痛苦，也可以选择无痛的胃镜。在做胃镜的时候采用超声内镜，既可以看到胃部表面的结构，也能够透过表面看到胃壁深层的结构。超声内镜就是超声和内镜的相结合，既能够看到脏器的腔的表面，又能够透过表面，用超声看到内部的结构的变化。