胆囊切除后的疼痛的原因主要如下：1、残余的胆囊管或胆总管结石：常见于炎症较重，或局部解剖结构发生变异，胆囊管过长容易引起残余胆囊管结石或胆总管结石，在胆囊切除手术之后出现，就会引起疼痛症状；2、Oddi括约肌痉挛：胆管下段的Oddi括约肌痉挛可引起胆道内压力升高，而导致疼痛，疼痛可以通过解痉止痛药物以及配合饮食缓解；3、其它慢性疾病：包括慢性胃炎、胰腺炎，甚至是某些肿瘤性疾病，在胆囊切除前没有诊断出来，这类疾病在胆囊切除手术后，疼痛症状会持续存在；4、生理状态：胆囊切除手术后早期可能出现右侧肩背部疼痛或伤口疼痛，疼痛症状通常不会持续太长时间。