经皮肾镜取石手术，通常在麻醉下进行，患者到手术室之后进行全身麻醉、半身麻醉即椎管内麻醉或局部麻醉。麻醉后让患者保持翻身俯卧或斜仰卧位，在B超或X线引导下获取皮肤到结石较顺畅的路径后，在皮肤切开1cm左右切口，通过穿刺针穿刺至结石附近肾盏内，穿刺成功后再通过导丝引导逐级扩张，建立直径几毫米的工作通道即可。通过穿刺进皮肤通道，直接穿刺进入肾脏，再通过内窥镜明确结石部位，通过激光或其他能量方式将结石打碎，对于较大结石碎块，可以通过通道取出。结石碎净后再通过直视下留置输尿管内支支架以及肾造瘘管缝合伤口，即可完成手术操作。