阿莫西林可以治疗幽门螺杆菌，幽门螺杆菌的根除方案是国际通用的四联疗法，经典的治疗方案就是阿莫西林联合其它抗生素，常用的是阿莫西林联合左氧氟沙星或克拉霉素，或者其它一系列的抗生素。阿莫西林在胃酸度下降的情况下，会有治疗幽门螺杆菌的作用，但不主张预防幽门螺杆菌感染，应在做过幽门螺杆菌金标准检测，证实有幽门螺杆菌感染以后才进行治疗。患者在使用阿莫西林时，应注意有延迟变态反应的情况，在青霉素皮试阴性，且既往没有过青霉素过敏的情况时，才进行幽门螺杆菌的治疗。阿莫西林对幽门螺杆菌治疗的有效率较高，且耐药率较低。因此，阿莫西林在治疗幽门螺杆菌方面比较高效。