脊柱两侧出现疼痛的原因主要如下：1、颈椎病：如腰椎间盘突出、脊柱肿瘤或感染等，会导致脊柱两侧疼痛；2、局部肌肉：如果脊柱后方肌肉长期处于劳损状态，如腰背肌筋膜炎、腰肌劳损等，也会导致脊柱两侧疼痛；3、风湿免疫系统疾病：如强直性脊柱炎，导致肌肉和韧带附着的位置出现无菌性炎症反应，也表现为脊柱两侧疼痛。所以，一旦出现脊柱两侧疼痛的情况，建议到医院进一步诊治。