奥美拉唑长时间服用，可以对人体造成一定危害，主要如下：1、可以引起机体对钙和镁等微量元素的代谢异常，所以如果超量服用，可能引起骨质疏松。特别是对于老年人，本身有合并骨质疏松时，可能危害更大；2、可以引起肠道细菌过度繁殖，特别是长时间在医院接受治疗的患者。这类患者长时间不能自主进食，如果长时间服用奥美拉唑，现象可能更为突出；3、长期服用奥美拉唑，可以刺激胃腔里面出现息肉，但通常不会向肿瘤疾病发展。但如果经如果医生诊断，如反流性血管炎、胃溃疡病等疾病，在医生的指导下，按照病程规律服用奥美拉唑。大部分病人在治疗期间，服用2-3个月，甚至半年的奥美拉唑，通常对机体并不会产生上述方面危害。所以主要还是遵循医嘱，避免过度对奥美拉唑潜在的伤害产生恐慌。