少数克罗恩病患者即使进行手术治疗，也有复发可能。克罗恩病是一种肠道自身免疫性疾病，可以累及到整个消化道。此外，克罗恩病还是一种肠道的全层炎，从里面的黏膜层到外面的浆膜层均有可能受累，故可能出现肠瘘、肠狭窄等问题。 在药物治疗困难的情况下，必要时会采取手术治疗，切除病变部位，在未切除的肠段可能会出现复发问题。因此在手术治疗之后，患者仍需回到内科进行进一步的系统治疗，包括活动期的治疗以及缓解期的维持治疗，内科医生会密切监测病情的发展。