跑步以后颈肩痛，可能是由有以下几个原因导致：1、运动剧烈或跑步时间较长：此时产生肌肉的劳损或者拉伤，患者会产生颈肩部疼痛的表现；2、患者较瘦弱：颈肩部的肌肉较薄弱，下肢力量比较强，这时上肢跟下肢肌力不对称、不协调，患者长时间跑步以后，也会容易产生颈肩部的疼痛；3、上肢肌力较薄弱：患者剧烈运动时可以产生损伤；4、肩周炎：年龄较大的患者可能存在肩周炎，原来有疼痛的症状存在，跑步后疼痛可能会加重；5、颈椎病：由于运动剧烈，跑步过程中收到冷风刺激，诱发颈椎病的发作，这时患者会产生颈肩部的疼痛；6、类风湿性关节炎：患者本身有基础疾病，因此跑步以后也会产生颈肩部的疼痛。