肾结石手术主要为微创手术，且不同微创手术有不同手术操作流程，具体如下：1、输尿管软镜：当肾结石较小，结石数量较少，可通过输尿管的软镜进行碎石。输尿管软镜手术没有创伤，手术过程较简单，将软镜插入尿道进入膀胱，在膀胱内找到两侧输尿管开口，软镜沿着输尿管开口钻入输尿管，通过输尿管进入肾脏中寻找肾脏结石，将肾脏结石打碎，并将其冲出或直接取出；2、经皮肾镜：在人体后背也就是肾区打一个小洞，镜子通过皮肤进入肾脏找到结石，将结石打碎并抽吸出，手术会有一定创伤，主要适用于结石较大，结石数量较多的患者。