因为热灌注化疗对患者免疫功能有一定抑制作用，所以当热灌注化疗后，患者易出现白细胞降低。因此热灌注化疗首先要求患者的体质要相对较好，若患者卧床不起，则不适合做热灌注化疗。 此外，由于热灌注化疗是通过腹腔加压进行动态灌注，会对患者肠道功能有一定影响。热灌注化疗后，可能会产生不同程度的肠粘连或肠梗阻。所以在热灌注化疗前，医生会根据患者的病情详细评估，减轻热灌注化疗的副作用。