肉毒杆菌不影响脑干。目前在临床上使用肉毒杆菌较多的第一可能是美容，第二可能是缓解肌张力障碍和治疗头痛。1、美容：很多美容师喜欢用肉毒杆菌注射来防衰老；2、缓解肌张力障碍和治疗头痛：神经科医生也比较喜欢将肉毒杆菌，应用于一些肌张力过高的患者。很多脑梗塞后的患者，手掰不开、腿掰不动，也就是肌肉挛缩的状态。这时候局部注射肉毒杆菌，可以让肌肉松弛。此外，长期不缓解的头痛的患者，也可以局部穴位注射肉毒杆菌，治疗这种长期的不可治愈的偏头痛。但是肉毒杆菌不会影响脑干，而且肉毒杆菌的不是所有患者都能使用，肉毒杆菌的注射有适应征。所以希望各位患者可以在医生的指导下，使用肉毒杆菌。