自闭症的病因目前不是很清楚，现有的已知资料表明，自闭症与遗传和脑损伤有关，对于遗传方式不是很清楚，并不是某个家族里有过自闭的孩子，就会再有另外一个，是不一定的。自闭症的遗传方式很复杂，应该属于多基因遗传，另外，可能与脑损伤有关，比如脑缺血缺氧、新生儿期窒息、肺炎、癫痫、脑内重要物质代谢异常，也会导致脑损害。有些孩子是两者兼有，有些孩子只有其一，也许还有其他原因，但目前不是很清楚。但是，自闭症不是与字面意思有关，并不是孩子的教导和养育中说话少、陪伴少，或者喜欢自己玩导致的。