男孩小便疼，常见原因有尿路感染、饮食因素以及包皮发炎等，具体内容如下：1、尿路感染：尿路有刺激症状，出现尿路疼；2、饮食因素：比如摄入辛辣食物，小便存在刺激性，男孩会主诉排尿疼痛；3、包皮发炎：出现包皮红肿，严重时会出现黄色分泌物，排尿时也会出现疼痛，此时需要将包皮切除，如包皮过长或过紧，均可以藏污纳垢。排尿后残留尿液留在包皮内，引起细菌感染。此时出现任何一种情况，需要到医院进行尿常规检查，清楚尿常规是否出现问题。