右侧附件区囊肿治疗方法如下：1、生理性卵巢囊肿：在怀孕早期形成的黄体囊肿，随孕周不断增加，囊肿可以自行消失；2、肿瘤：如右侧卵巢浆液性囊腺瘤、黏液性囊腺瘤、畸胎瘤等，建议手术切除、送检病理活检明确性质；3、子宫内膜异位疾病：卵巢子宫内膜移位囊肿属于子宫内膜异位症，易恶变、破裂、与周围脏器粘连，如与输卵管、盆腔腹膜、子宫后壁、肠管、肠系膜等粘连。因此盆腔子宫内膜异位症不仅需要手术切除，术后还要用药防止复发；4、右侧输卵管系膜囊肿：通常无需治疗，如果系膜囊肿不断增大或扭转引发腹痛，要给予治疗；5、宫外孕：如右侧输卵管妊娠导致停经、腹痛和出血，建议手术。如果具备保守治疗指征，在患者同意的情况下，可以用药进行治疗；6、炎症或恶性肿瘤：针对炎症可以运用保守治疗方案，如果涉及急性盆腔脓肿，需要手术引流。涉及恶性肿瘤，通常需要进行肿瘤细胞减灭术、辅助放化疗等。