适量食用乳铁蛋白，对人体没有明显副作用，但如果不加节制地食用，对人体会有副作用。乳铁蛋白中含有一定量的蛋白成分，在体内代谢的过程中会产生分解产物，分解产物需要通过肾脏排出体外。​所以不加节制地食用乳铁蛋白，产生大量代谢产物，通过肾脏排出时会加重肾脏代谢负担，进而引起肾脏功能下降，导致排尿量减少，过多液体储存在体内，导致全身浮肿风险增加。如果不加节制地食用乳铁蛋白，会在代谢过程中产生嘌呤成分。嘌呤在体内蓄积，会引起血液中尿酸水平增高，尿酸是导致痛风的重要原因，会诱发痛风的急性发作，影响身体健康。