肛瘘有单纯性肛瘘和复杂性肛瘘。对于单纯性肛瘘，手术切除瘘管以后，其预后效果较好，一般不会留下后遗症，对于复杂肛瘘，特别是深部高位肛瘘，在手术过程中要注意保护肛门括约肌的功能，手术创面较深，手术后留有较大疤痕，会出现术后肛门狭窄、肛门失禁或紧急情况下的肛门不自主溢便，控便效果不好、肛门缺损会比较严重，另外也会导致肛瘘复发。高位复杂性肛瘘最主要的关键是内口处理、预防术后复发。