目前在临床上，无论是西医、中医、教科书、临床指南上，均没有建议、表明以及证据，证明藿香正气水可以用来治疗痔疮。藿香正气水可清热解毒，而痔疮并不是热性或毒性疾病，并不需要清热解毒进行治疗。​痔疮本身是迂曲的血管团，主要症状有2个，即出血，如间断性大便带血为鲜红色血液以及便后滴血，还有肛门外面有间断性脱出物。治疗痔疮有很多简单、方便的方法，其中最常用的是温盐水坐浴，用盆子倒入半盆温水，水温在37-42℃，再加食盐兑成温盐水，臀部直接坐在里面泡20-30分钟。在能适应的情况下，水温维持在40℃左右，坚持1周后大部分痔疮都会得到缓解。