先天性脑动静脉畸形的手术后遗症取决于动静脉畸形的部位、大小以及手术的结果。有些动静脉畸形位于功能区，对于功能区的动静脉畸形，无论采取任何治疗手段，都有可能面临一定程度的功能影响，包括肢体功能影响。部分患者手术完成之后导致瘫痪，或者畸形位于语言功能区，可能会造成患者失语，包括运动性失语，不会讲话或者听不懂话等相关的语言功能影响，也可能造成听力各方面的影响，甚至有些部位的动静脉畸形做完手术之后患者会发生昏迷，类似植物人。 所以，先天性脑动静脉畸形的手术后遗症是一个很笼统的概念，取决于畸形的部位，大小以及相应的手术所带来的合并症。