怀孕时同房多数不会导致胎儿畸形，尤其是在妊娠中期进行同房，基本不会引起胎儿畸形。但在妊娠早期一般不建议进行同房，因为在怀孕早期由于胚胎刚着床，还不十分稳定，此时性生活的某些机械性的刺激、摩擦或冲撞都可能增加流产发生的风险。怀孕早期胚胎的各个器官、系统，都处于快速分化发育的时期，对于外界的不良因素非常敏感，此时同房若由于性生活所带入细菌、病毒或其他的病原微生物，可能发生生殖道感染。而生殖道感染一旦发生上行感染进入宫腔，便有可能影响胎儿，引起流产、早产，甚至是发生胚胎停育和胎儿畸形。所以孕早期即怀孕12周以内，一般不建议孕妇进行性生活，到妊娠中期在孕妇没有任何不适的情况下，不存在腹痛出血、前置胎盘等妊娠期合并症和并发症的情况下，可以适当的增加性生活。但是性生活时动作要轻柔，另外要及时清洗外阴，避免感染的发生。