全耳再造手术最大风险为感染，无论术后急性期感染或远期感染，对于全耳再造手术均为致命打击。如果术后近期出现感染，可能会造成皮瓣不存活，引起耳廓支架感染变形，影响整体耳再造效果。如果是远期感染，大多数由于耳廓外伤造成皮肤损伤，引起耳廓支架外露。如果为简单少量外露，可通过清创或局部皮瓣覆盖挽救，但较严重外伤有可能需要再次手术进行挽救。此外，部分风险来源于供区，因为耳再造较常用自体肋软骨，取出部位有感染、瘢痕、出血、畸形风险，但因为可控，所以并发症发生率较低。