小肠疾病的检查方法，主要包括小肠镜、胶囊内镜、全消化道造影、小肠CT、小肠核磁。这些检查手段各有优缺点，一般检查是从易到难进行，具体如下：1、全消化道造影：可以观测到小肠的整个形态，对于突起性的肿瘤病变，通常有很好的诊断价值，但是不能取病理；2、胶囊内镜：可以直观地观测小肠黏膜，对于血管病变、溃疡或者肿瘤，都有很好的观测效果，但是不能取病理，价格比较贵；3、小肠镜：能够直观地观测到小肠黏膜，也能够观测到各种疾病，并且能取病理进行明确诊断，但是价格昂贵，操作困难，病人痛苦；4、小肠CT：对于小肠肿瘤的疾病，能够得到很好的诊断，而且能够观察淋巴结转移，以及肿瘤与周边脏器的关系；5、小肠核磁：可以明确地诊断小肠肿瘤的数量、大小等。这些检查都是各有优缺点，在临床中互相补充观察，通常有利于小肠疾病诊断。