通常紧急避孕药的危害较大，因其雌孕激素含量较高，较多患者服用后可能改变月经规律，表现为服完药后突然出现阴道出血，类似于月经，且出血时间较长，此时部分患者保守治疗可能无效，需要整刮(妇科刮宫手术)才能止血。还有部分患者会出现恶心、呕吐、头昏等不适表现。紧急避孕药作为同房后补服的避孕药，服用后也有怀孕的可能性，意外怀孕时可能需进行人工流产。短效避孕药相对较安全，但也有一定副作用，所以用药者不应属于禁忌人群，即女性肝肾功能正常且没有说明书上的疾病，如卵巢肿瘤、内膜肿瘤、乳腺恶性疾病或无法控制的高血压、糖尿病，以及曾出现中风，此时均不适合服用。对于存在血栓高危风险的女性，如年纪较大且伴有肥胖，或频繁抽烟，均不适合口服短效避孕药，因为长期使用避孕药可能导致血液黏滞度增高，从而增加血栓风险。