练腿后第三天更疼可能有以下原因：

1. 乳酸堆积。练腿后如果运动过度，拉伸不到位，可能导致肌肉乳酸分泌过多。当乳酸堆积时，机体不能将其完全吸收，可能在第三天出现腿更疼的症状。可以考虑通过运动牵伸，同时配合磁热疗的方法缓解，促进乳酸吸收。
2. 肌肉软组织拉伤。练腿的过程中如果用力过度，可能出现腿部肌肉软组织拉伤，导致第三天疼痛加重的现象。主要与局部渗出液增加有关，需要考虑通过运动康复，同时配合筋膜刀的方法进行缓解。
3. 局部炎症。如果腿部出现炎症，如筋膜炎，无菌性炎症的刺激可使局部产生疼痛的症状。在练完腿后第三天，由于局部炎性渗出物的增加，可能会使疼痛加重，可以遵医嘱服用非甾体抗炎药进行缓解，如塞来昔布胶囊、美洛昔康片等。
4. 延迟性肌肉酸痛。练腿后第二天通常会出现延迟性肌肉酸痛，一般会维持3～5日，第三天比第二天会有疼痛感加重属于正常现象，经过肌肉拉伸、推拿、按摩、热敷等处理后，症状会有所缓解。

此外，还有可能是骨关节损伤、韧带肌肉损伤、营养缺乏等原因导致疼痛。如果在练腿后第三天出现更严重的疼痛症状，建议及时就医，以便得到准确的诊断和治疗。