板蓝根和金银花在以下四个方面存在区别：
1. 药用部位：板蓝根主要药用部位是十字花科植物菘蓝的根，而金银花是忍冬科植物忍冬的花蕾。
2. 性味归经：板蓝根和金银花均性寒，归心经、胃经，但板蓝根味苦，金银花味甘，另外，金银花还可归肺经。
3. 功效：板蓝根具有清热解毒、凉血利咽的功效，而金银花有清热解毒、凉散风热的功效。
4. 其他：板蓝根具有抗细菌、抗内毒素、增强免疫调节等作用，而金银花具有抗病原微生物、抗炎、解热、促进炎细胞吞噬功能、降血脂、中枢兴奋、预防胃溃疡、兴奋子宫等作用。
总的来说，板蓝根和金银花虽然都具有清热解毒的功效，但在药用部位、性味归经、功效等方面存在差异，需要根据具体病情和身体状况进行合理使用。
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