急性肠胃炎引起39℃高烧时，可以采取以下措施：
1. 完善检查：进行血培养、大便培养及大便常规等检查，结合近期吃的食物，查明致病微生物，明确病因。
2. 控制感染：根据药敏试验结果，遵医嘱选择针对性的抗生素治疗，如诺氟沙星、庆大霉素等进行抗感染治疗，从而控制炎症。
3. 对症用药：
* 补液：高热出汗较多者需警惕脱水的发生，可根据情况给予口服补液盐或静脉补液以预防水、电解质紊乱。
* 解痉止痛：伴有剧烈腹痛者可应用阿托品、复方颠茄片缓解疼痛。
* 止吐、止泻：可应用蒙脱石散、甲氧氯普胺等缓解呕吐、腹泻的症状。
* 物理方法：可以应用冰敷或用凉水、酒精擦拭身体，利用液体挥发带走身体的热量，从而达到降温的目的，或者使用退热贴等也可以达到相同的效果。
* 其他：如果查明为食物中毒引起，必要时可通过洗胃尽量减少摄入有毒物质，也可在医生指导下应用对应的解毒药物。
建议改善日常饮食结构，以清淡、易消化饮食为主，如米粥，多吃水果、蔬菜，保持规律饮食，做到少食多餐，禁食生冷、坚硬、辛辣、刺激以及不洁食物，避免引起肠道感染。如果出现呕吐、腹泻等症状，建议禁食并及时去医院就诊。
以上措施仅供参考，请务必咨询医生或专业人士。
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