巧克力囊肿可能会引起腹痛。具体有以下两种原因：
1. 巧克力囊肿在来月经的时候，局部的异位症病灶也会出现出血的现象，会导致局部出现长大，在临床上造成腹痛的情况。
2. 巧克力囊肿出现疼痛，在临床上主要是由于这种疾病常常会导致组织出现黏连，出现腹痛的现象。
当巧克力囊肿的患者出现腹痛的情况，通常可通过以下方式进行治疗：
1. 开腹手术：通过切除子宫和子宫内膜异位的病灶，保留卵巢的功能，达到治疗的目的。
2. 腹腔镜微孔手术：在腹部打上小孔，在腹腔镜的帮助下，把巧克力囊肿去除。是一种微创无痛的手术，副作用小，而且恢复的快。
以上信息仅供参考，当出现巧克力囊肿引起腹痛的情况时，建议及时就医，医生会根据症状的严重程度、个人情况和健康历史来制定最适合的治疗计划。
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