月经干净后三天又来了可能是以下原因导致：
1. 子宫内膜疾病：如子宫内膜息肉、子宫内膜增生等，可能是由于内膜的异常增生导致不规则的出血。可以服用一些消炎的药物进行治疗。
2. 未完全排空：有时候在月经结束时，子宫内的血液并没有完全排空，残留的血液可能在几天后排出，导致出血。
3. 卵巢功能异常：如早泄或晚排卵，导致月经周期紊乱，例假结束后不久又出现出血。
4. 宫颈问题：如宫颈炎症、息肉或其他宫颈问题可能导致出血，即使在月经结束后也可能发生。
5. 荷尔蒙失调：荷尔蒙失调可能导致月经周期紊乱，包括例假结束后的异常出血。
建议咨询妇科医生进行进一步的检查和诊断，以确定具体原因并制定合适的治疗计划。在阴道流血期间需要保持外阴卫生，禁止同房。
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