微浸润癌和原位癌的主要区别在于是否突破了基底膜。
原位癌，也被称为上皮内癌，通常仅累及上皮全层，即病变细胞在形态和生物学特性上与癌细胞相同。这些细胞尚未突破基底膜向下浸润，这也是原位癌的一个关键特征。原位癌主要出现在鳞状上皮或尿路上皮等被覆的部位，如子宫颈、食管、皮肤膀胱等处，有时也出现在发生鳞状化生的黏膜表面，如鳞化的支气管黏膜。因为原位癌没有浸润和转移的能力，所以预后通常较好。
微浸润癌则是指癌细胞突破了基底膜，向下浸润。由于浸润深度不大（小于5mm），因此通常被称为微浸润癌。微浸润癌属于早期癌，一般不会发生远处转移。
综上所述，微浸润癌和原位癌的主要区别在于病变细胞的浸润深度。原位癌的细胞尚未突破基底膜，而微浸润癌的细胞已经突破了基底膜向下浸润，但浸润深度较小。
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